با توجه به آسیب های زیست محیطی احتمالی ناشی از فعالیت های معدن مس سونگون مرتبط با از بین رفتن پوشش گیاهی و ایجاد آلودگی در منابع آب زیر زمینی، شناسایی و ارزیابی ریسک های زیست محیطی و طبقه بندی آن ها در دستور کار قرار گرفت.
مطالعات مرحله اول شامل جمع آوري كليه اطلاعات مجتمع بهره برداري مس سونگون، تجزيه و تحليل مطالعات زيست محيطي انجام شده و تعيين نقاط ضعف و قوت آنها، طبق ضوابط و استانداردهاي ملي و بين المللي و همچنين معيارهاي مربوط به ارزيابي ريسك براي كليه سامانه هاي طرح بوده است. مطالعات مرحله دوم شامل شناسايي و دسته بندي ريسك هاي محتمل تجزيه و تحليل سناريوهاي خطر، عوامل بروز خطا و چگونگي وقوع آنها كنترل هاي موجود برآورد پيامدها، تعيين آلاينده ها، شناسایي اثرات بر آب هاي سطحي زيرزميني خاك و هوا و صوت بوده و كليه فعاليت ها در شرايط عادي و بحراني دسته بندي گرديدند. مطالعات مرحله سوم شامل شناخت سيستم، طبقه بندي ريسك ها به انساني، طبيعي، انساني طبيعي و همچنين طبقه بندي ريسك ها بر حسب شدت زيان و آسيب در آب، خاك، هوا و انسان، و ارائه راهكارهاي مديريتي.